More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3219 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  87.63 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  72.82 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  69.25 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  60.73 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  56.84 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  56.32 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  59.21 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  56.6 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  58.31 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  48.27 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  51.45 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  42 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  49.14 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  48.28 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  48.53 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  48.48 
 
 		 398 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  47.22 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  39.17 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.43 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.43 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.58 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.43 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 403 aa  223  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.16 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 407 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.83 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.08 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  49.85 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  41.14 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  39.9 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  39.9 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  37.93 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.53 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  38.92 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>