92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3125 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
144 aa  300  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  91.67 
 
 
144 aa  279  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.636265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  62.68 
 
 
150 aa  197  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2830  GCN5-related N-acetyltransferase  62.69 
 
 
145 aa  188  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  56.39 
 
 
145 aa  178  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1419  putative acetyltransferase  56.92 
 
 
139 aa  168  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1517  GCN5-related N-acetyltransferase  56.35 
 
 
138 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  49.21 
 
 
138 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.313389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  47.24 
 
 
132 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.404127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  47.75 
 
 
133 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0108675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4442  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
134 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1759  GCN5-related N-acetyltransferase  52.75 
 
 
93 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.200075  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  38.84 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398514  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0471867  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5770  hypothetical protein  46.77 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3092  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3028  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  32 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21101  GNAT family acetyltransferase  29.29 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0773  hypothetical protein  32 
 
 
201 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208077  normal  0.373974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
167 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3134  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703967  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1231  putative acetyltransferase, GNAT family  27.13 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2832  acetyltransferase  26.55 
 
 
134 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3471  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107886  normal  0.412384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1637  acetyltransferase  33.33 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.240715  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2612  acetyltransferase  26.55 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2810  acetyltransferase, GNAT family  26.55 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000256383 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2802  acetyltransferase  26.55 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.613256  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2560  acetyltransferase  25.66 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0379943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1645  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2606  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.504946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01210  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.72 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2852  acetyltransferase, GNAT family  26.88 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000771484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2811  acetyltransferase, gnat family  25.66 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0079  hypothetical protein  28.26 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.668826  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3498  GCN5-related N-acetyltransferase  23.85 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.91187  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0845  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.084363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2529  acetyltransferase  26.88 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0100563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13460  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  28.57 
 
 
140 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2479  acetyltransferase, gnat family  23.89 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109515  normal  0.550388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  29.76 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4876  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3490  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0373267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0079  hypothetical protein  26.09 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4968  GCN5-like N-acetyltransferase  27.16 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2483  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1128  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412545  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00911  putative acetyltransferase, GNAT family  23.26 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0344601 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17681  GNAT family acetyltransferase  21.28 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3488  hypothetical protein  25.3 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0164567  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2929  acetyltransferase  32.88 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.031878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3143  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.249751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5410  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.130099  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08300  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.48 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1817  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0569888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  23.53 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43627  predicted protein  37.33 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08251  putative acetyltransferase  33 
 
 
166 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
157 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
158 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  23.45 
 
 
176 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481463  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5731  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18291  GNAT family acetyltransferase  25 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4885  acetyltransferase  26.81 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3730  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765568  normal  0.328429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.33 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2504  acetyltransferase, GNAT family  28.83 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258903  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_7981  predicted protein  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>