151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3020 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  84.51 
 
 		 455 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  100 
 
 		 453 aa  938    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  49.77 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  47.96 
 
 		 440 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  48.3 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  47.96 
 
 		 440 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  47.74 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  47.96 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  48.87 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  47.74 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  47.74 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  46.38 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  46.31 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  45.93 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  35.27 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  34.89 
 
 		 441 aa  236  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  34.44 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  34.37 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  34.44 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  34.44 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  34.44 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  34.22 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  34.22 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  34.16 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  34.15 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  34.22 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  31.26 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  31.24 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  28.11 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  31.86 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  30.94 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  33.33 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  31.47 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  31.73 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  29.71 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  30.77 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  30.52 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  31.71 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  31.98 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  28.18 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  31.44 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  29.82 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  29.83 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  29.83 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  29.83 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  29.61 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  29.83 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  30.04 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  30.04 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  29.61 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  30.28 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  30.63 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  32.8 
 
 		 410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  30.8 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  28.54 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 461 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  28.99 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.9 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  31.76 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  24.27 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  27.94 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  29.9 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  24.78 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  24.35 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.65 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  23.21 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  26.36 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  28.57 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  27.11 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  23.19 
 
 		 432 aa  113  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  23.91 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  26.77 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  25.33 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  24.07 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  22.22 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  26.36 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  24.77 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  25.17 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  25.21 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  23 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>