284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3011 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  80.41 
 
 		 393 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  78.12 
 
 		 393 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  80.41 
 
 		 393 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  82.19 
 
 		 393 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  100 
 
 		 393 aa  799    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  97.2 
 
 		 393 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  80.41 
 
 		 393 aa  657    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  81.17 
 
 		 393 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.86 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.86 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.86 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  77.1 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  77.35 
 
 		 392 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.61 
 
 		 392 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.1 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  77.1 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.1 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.1 
 
 		 392 aa  607  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  77.61 
 
 		 392 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.59 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.84 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  76.59 
 
 		 392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  75.57 
 
 		 392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  47.72 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  44.59 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  44.42 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  44.76 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  42.75 
 
 		 385 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  40.9 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.23 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  40.26 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.23 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.46 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.92 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.97 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  39.49 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.72 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.72 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.72 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  38.86 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  37.56 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  36.18 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.66 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.54 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  34.27 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  37.73 
 
 		 372 aa  259  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  34.5 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.18 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.43 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  32.99 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  35.85 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.2 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.81 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.94 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  32.2 
 
 		 380 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  32.2 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  33.16 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  33.16 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2982  Pyrrolo-quinoline quinone  32.22 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  32.66 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  32.75 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1251  quinoprotein  32.62 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  32.35 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  31.79 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  31.55 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.11 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  30.49 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  30.23 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  32.05 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  31.02 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  30.75 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  31.44 
 
 		 388 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.72 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.76 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.17 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.53 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  32.5 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.18 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  31.65 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.9 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  31.5 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.04 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.94 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  31.94 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1288  Pyrrolo-quinoline quinone  30.18 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  30.67 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  31.67 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  31.39 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>