More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2977 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  95.32 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  67.69 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  67.69 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  67.69 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  67.7 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  61.74 
 
 		 299 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.367743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  61.07 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  61.07 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  61.41 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  61.41 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  61.07 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  60.74 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  60.74 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  60.4 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  60.54 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  46.33 
 
 		 309 aa  265  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  45.87 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  45.39 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  45.73 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  47.26 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  45.39 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  47.46 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  44.9 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  45.45 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  44.22 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  44.22 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  43.15 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  45.18 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  44.9 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  40.48 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  40.58 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  40.13 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  41.2 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  33.71 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  33.33 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  33.33 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  33.33 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  32.45 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  32.08 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  32.21 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  32.3 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  31.63 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  28.87 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  28.17 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  30.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  28 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  30.58 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  31.25 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  28.74 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  28.52 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  29.71 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  29.93 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  28.57 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  28.57 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  28.35 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  31.91 
 
 		 291 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  28.35 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  28.01 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  28.57 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  29.91 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  28.17 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  27.91 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  30.27 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  30.26 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  29.5 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  29.05 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  31.28 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  27.86 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1578  putative lipid kinase  29.46 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.95 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  31.4 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  30.77 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  30.07 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  26.33 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  30.72 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  31.51 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  28.72 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  24.75 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  27.43 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  32.03 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  30.77 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  30.77 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  31.82 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>