More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2949 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  97.87 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  87.94 
 
 		 141 aa  261  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  86.52 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  78.01 
 
 		 141 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  75.18 
 
 		 141 aa  227  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  73.57 
 
 		 141 aa  223  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  75.71 
 
 		 141 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  74.47 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  74.47 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  75.18 
 
 		 141 aa  220  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  75.18 
 
 		 141 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  78.01 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  78.01 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  78.01 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  77.3 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  78.01 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  74.82 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  76.6 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  71.63 
 
 		 141 aa  209  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  71.22 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  77.3 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  67.38 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  73.05 
 
 		 141 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  68.09 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  68.09 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  68.12 
 
 		 141 aa  199  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  66.67 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  65.96 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  71.22 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  68.38 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  63.57 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  64.18 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  64.18 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  63.43 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  64.18 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  62.5 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  64.96 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  61.94 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  62.69 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  67.86 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  64.23 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  64.23 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  63.5 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  63.5 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  63.5 
 
 		 139 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  61.31 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  62.77 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  62.5 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  62.5 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  62.5 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  69.34 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  62.5 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  62.5 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  63.04 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  60.58 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  64.54 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  60.58 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  62.5 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  61.76 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  61.76 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  61.76 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  58.7 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  66.2 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  63.5 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2305  organic hydroperoxide resistance protein  67.86 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  62.32 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1104  OsmC family protein  62.86 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  56.74 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1196  organic hydroperoxide resistance protein  62.86 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.380059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  59.12 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  54.68 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  54.68 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  55.4 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  57.66 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  58.39 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1671  OsmC family protein  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  57.66 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  59.09 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  56.34 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  54.68 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  59.15 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  54.68 
 
 		 138 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  57.78 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  61.03 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  60.99 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  60.99 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  60.28 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  54.29 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  53.62 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  53.62 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  53.62 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  51.43 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  61.76 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  54.29 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2957  OsmC family protein  57.25 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  50.36 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  54.29 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>