89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2782 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  92.13 
 
 		 216 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  88.2 
 
 		 185 aa  332  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  83.51 
 
 		 203 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  79.66 
 
 		 184 aa  304  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  76.12 
 
 		 201 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  80.66 
 
 		 182 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  80.66 
 
 		 182 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  80.66 
 
 		 182 aa  285  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  82.08 
 
 		 184 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  82.08 
 
 		 184 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  82.08 
 
 		 184 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  82.08 
 
 		 184 aa  284  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  82.08 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  81.29 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  40.74 
 
 		 178 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  39.51 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  37.87 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 178 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  35.71 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 170 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 		 459 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 178 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 169 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.85 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.14 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.07 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.67 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.37 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.65 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.29 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  26.9 
 
 		 161 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.03 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.74 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  26.9 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.61 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  23.4 
 
 		 331 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.68 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.73 
 
 		 176 aa  45.1  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  22.08 
 
 		 451 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.89 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  29.69 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.89 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 130 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  32.06 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.46 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.58 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  28.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  37.29 
 
 		 319 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.21 
 
 		 191 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.6 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.59 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>