More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2718 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 515 aa  1053    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.53 
 
 		 501 aa  262  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.64 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.64 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  32.49 
 
 		 519 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.99 
 
 		 515 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.19 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  33.2 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.16 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.26 
 
 		 500 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.33 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.45 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  33.27 
 
 		 493 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  32.46 
 
 		 493 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  31.56 
 
 		 536 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  33.4 
 
 		 496 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  32.46 
 
 		 493 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  32.46 
 
 		 493 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.54 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  33.13 
 
 		 484 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  32.46 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.93 
 
 		 484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  32.26 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  32.26 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.55 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  29.59 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.06 
 
 		 496 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.72 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.72 
 
 		 484 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.4 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  29.49 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  29.49 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  29.49 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.33 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.91 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.16 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.98 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  32.66 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.47 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  33.33 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.33 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  33.02 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  32.24 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.64 
 
 		 509 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  32.24 
 
 		 484 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  28.89 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.88 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  35.97 
 
 		 482 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  33.82 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  30.82 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  28.57 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  32.45 
 
 		 472 aa  203  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  31.91 
 
 		 492 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.94 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  30.96 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  28.19 
 
 		 498 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  33.53 
 
 		 493 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  28.19 
 
 		 498 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.37 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  28.19 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  30.97 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  27.99 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  31.16 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  28.19 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  27.96 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.96 
 
 		 484 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.96 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.96 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.96 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.96 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  32.6 
 
 		 492 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  31.33 
 
 		 492 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  32.74 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  32.74 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  30.75 
 
 		 484 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  34.36 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  30.75 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.57 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  30.85 
 
 		 484 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  30.38 
 
 		 487 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.69 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.55 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.43 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.13 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  32.13 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  32.13 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.61 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.13 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  30.48 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  32.09 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  32.63 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  32.63 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.93 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  30.61 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.07 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>