261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2713 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 241 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  73.73 
 
 		 239 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  59.91 
 
 		 239 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  59.48 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  59.48 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  59.48 
 
 		 239 aa  294  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  59.05 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  55 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  51.29 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  48.31 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  47.46 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  47.46 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  47.03 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  42.98 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  42.98 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  41.88 
 
 		 230 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  34.89 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  34.6 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.06 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.02 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.78 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  34.1 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  29.74 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.33 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  31.22 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  28.39 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  32.98 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  32.86 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.17 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.54 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  39.61 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  26.89 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  31.06 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  32.38 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  30.08 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  26.12 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  30.43 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  30.58 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  29.38 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  30.52 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.34 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  35 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  27.72 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  27.72 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  29.02 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.05 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.53 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  32.48 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  33.09 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  27.62 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  29.22 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  27.71 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.1 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  32.66 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  27.88 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.7 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32.11 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  28.08 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  27.7 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  29.79 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>