216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2591 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  98.64 
 
 
369 aa  717    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
369 aa  727    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  82.6 
 
 
366 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1560  flagellar basal body P-ring protein  82.93 
 
 
369 aa  567  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2005  flagellar basal body P-ring protein  80.22 
 
 
369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2317  flagellar basal body P-ring protein  80.22 
 
 
369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2418  flagellar basal body P-ring protein  80.22 
 
 
369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.097185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01076  flagellar P-ring protein precursor I  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2566  flagellar P-ring protein  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  80.05 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2520  flagellar basal body P-ring protein  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1203  flagellar basal body P-ring protein  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0939901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01084  hypothetical protein  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.981614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1203  flagellar basal body P-ring protein  79.78 
 
 
365 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  79.51 
 
 
365 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2007  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0317412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2191  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000395183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1278  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1249  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1293  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 
365 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.160652  hitchhiker  0.00453741 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1594  flagellar basal body P-ring protein  77.94 
 
 
358 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1532  flagellar basal body P-ring protein  75 
 
 
369 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.760833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  63.04 
 
 
392 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  60.42 
 
 
391 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  60.16 
 
 
391 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  60.16 
 
 
391 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  60.81 
 
 
369 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  62.22 
 
 
392 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  61.89 
 
 
394 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
401 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
397 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
397 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  62.67 
 
 
377 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
401 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  62.4 
 
 
392 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  62.4 
 
 
394 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
401 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
400 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
400 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  62.75 
 
 
394 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  61.88 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  57.53 
 
 
377 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  60.97 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  59.89 
 
 
369 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  58.24 
 
 
385 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  58.4 
 
 
392 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  61.67 
 
 
395 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  58.79 
 
 
368 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  60.94 
 
 
398 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  61.06 
 
 
395 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  59.6 
 
 
372 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  59.6 
 
 
372 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  55.83 
 
 
365 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  54.7 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
372 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
372 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  54.29 
 
 
382 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  56.73 
 
 
384 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 
385 aa  348  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  51.56 
 
 
380 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
376 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  56.41 
 
 
388 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.87 
 
 
372 aa  342  5e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  54.6 
 
 
374 aa  342  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  54.31 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  50.43 
 
 
401 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 
367 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  48.81 
 
 
376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 
369 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  47.38 
 
 
379 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 
366 aa  332  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
369 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
369 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0756  flagellar basal body P-ring protein  56.67 
 
 
364 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 
362 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  49.86 
 
 
369 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  48.61 
 
 
371 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  49.43 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  49.43 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 
365 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
364 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  48.24 
 
 
391 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  48.32 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  47.43 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 
363 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 
371 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  46.01 
 
 
373 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  51.15 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  46.41 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.13 
 
 
363 aa  299  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  44.2 
 
 
362 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  45.58 
 
 
370 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  44.77 
 
 
378 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44.86 
 
 
363 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  45.95 
 
 
374 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 
370 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  44.86 
 
 
363 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>