271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2586 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 
89 aa  173  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  84.27 
 
 
89 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  96.63 
 
 
89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  70.79 
 
 
89 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  82.02 
 
 
89 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  82.02 
 
 
89 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  82.02 
 
 
89 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  70.79 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  73.03 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  73.03 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  73.03 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  73.03 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  61.18 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.67 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 
89 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2143  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.133607  hitchhiker  0.00525204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1699  flagellar biosynthetic protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000286094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1070  flagellar biosynthesis protein FliQ  73.03 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000496508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2726  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00753995  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1693  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000125927  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1235  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102862  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2182  flagellar biosynthesis protein FliQ  74.16 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000314942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.55 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.99 
 
 
83 aa  91.3  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1611  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  60.67 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5302  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.65 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.84251  normal  0.100483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0039  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0037  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0031  flagellar biosynthesis protein FliQ  64.2 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0034  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0055  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0028  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0036  flagellar biosynthesis protein FliQ  66.67 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2685  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0244  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0033  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.810295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.05 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2692  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3267  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1860  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.681176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0033  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.12 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  44.32 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.18 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.98 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3220  flagellar biosynthesis protein FliQ  65.38 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0154  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3781  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1847  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.02 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.18 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1671  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.28 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.9 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  39.77 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0155  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.88 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>