103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2584 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  89.29 
 
 		 140 aa  250  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  63.36 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  63.33 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  59.54 
 
 		 178 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  60.48 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2956  flagellar biosynthesis protein FliO  61.48 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  40.98 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  46.74 
 
 		 186 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  44.25 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.66 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  43.62 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  38.1 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  38.1 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  39.09 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  47.56 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  43.9 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  46.34 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  46.34 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  40.38 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.81 
 
 		 193 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.81 
 
 		 193 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  42.68 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  42.68 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  34.96 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  42.68 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  42.68 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  42.68 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  42.68 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  42.68 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  37.93 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  40.74 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  36.27 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.41 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  40.16 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  35.29 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.14 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.79 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.29 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  47.92 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  41.27 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.96 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  43.08 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.74 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.39 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.55 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  37.21 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.26 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  35.8 
 
 		 209 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2180  flagellar biosynthesis protein FliO  40.16 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000296305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1701  flagellar biosynthesis protein FliO  39.37 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.87 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.63 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.85 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2047  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1695  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18935  normal  0.0258842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  44.26 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  44.26 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  45.9 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2724  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0658443  normal  0.30284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  33.01 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  33.71 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.43 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1068  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024308  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  32.91 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  40.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  28.95 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  29.9 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  33.77 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.85 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.77 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.7 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.31 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  29.76 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  35.29 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  29.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  35.16 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  42.31 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2916  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  32.95 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0559  hypothetical protein  46.3 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  30.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  30.56 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.46 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  30.56 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  35.35 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  29.47 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  29.07 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  31.94 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.56 
 
 		 135 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.33 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  36.36 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  42.86 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.42 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>