188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2572 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  82.09 
 
 		 135 aa  233  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  80.15 
 
 		 132 aa  217  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  80.15 
 
 		 132 aa  217  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  79.39 
 
 		 132 aa  216  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  76.12 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  73.53 
 
 		 136 aa  204  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  67.91 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  71.65 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  71.65 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  71.65 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  71.65 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  70.87 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  63.2 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  61.29 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  60.48 
 
 		 136 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  58.27 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  56.8 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  56.78 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  50 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4164  flagellar protein FliS  57.94 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  55.2 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  52.34 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  50.41 
 
 		 144 aa  129  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  50.41 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  50.82 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  52.07 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  49.18 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  52.03 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  48.36 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  48.36 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  47.54 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  50.82 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  49.17 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  47.54 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  47.54 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  47.54 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0202  flagellar protein FliS  45.9 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  51.69 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  51.69 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  45.93 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  48.78 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  49.58 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  44.72 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  44.72 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  43.9 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  44.35 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  42.62 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  45.53 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  44.72 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  46.46 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  46.46 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  43.9 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  41.46 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  43.9 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  47.9 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  45.08 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  47.5 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  41.73 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  42.37 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  47.24 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  37.31 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  42.4 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  40.31 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  40.16 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  39.37 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  39.5 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  37.9 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  42.48 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  39.37 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  40.68 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  39.34 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  37.5 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  42.15 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2832  flagellar protein FliS  39.84 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0132865 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  35.09 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  39.39 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  36.72 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>