174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2523 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  76.91 
 
 
511 aa  852    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  78.02 
 
 
517 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  76.65 
 
 
517 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  71.4 
 
 
559 aa  745    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  77.1 
 
 
511 aa  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  66.67 
 
 
641 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  77.82 
 
 
517 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  66.46 
 
 
642 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  76.85 
 
 
517 aa  856    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  69.76 
 
 
604 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  62.57 
 
 
517 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  78.02 
 
 
517 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  70.99 
 
 
579 aa  746    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  83.33 
 
 
522 aa  924    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  84.67 
 
 
522 aa  943    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  70.93 
 
 
525 aa  772    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  76.33 
 
 
533 aa  840    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  76.91 
 
 
511 aa  852    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
522 aa  1076    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  62.38 
 
 
511 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  71.4 
 
 
579 aa  745    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  69.11 
 
 
505 aa  744    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  70.54 
 
 
525 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  98.08 
 
 
522 aa  1061    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  80.47 
 
 
511 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  77.1 
 
 
511 aa  854    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  78.02 
 
 
517 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  77.1 
 
 
511 aa  854    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  78.02 
 
 
517 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  80.84 
 
 
522 aa  902    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  76.85 
 
 
517 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  70.58 
 
 
559 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  79.77 
 
 
528 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  77.1 
 
 
511 aa  854    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  58.6 
 
 
536 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  53.29 
 
 
530 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  53.29 
 
 
520 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  49.52 
 
 
519 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  52.26 
 
 
504 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  50.49 
 
 
533 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  49.8 
 
 
588 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  46.94 
 
 
514 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  43.88 
 
 
522 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  41.6 
 
 
541 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  43.32 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  43.36 
 
 
519 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  44.26 
 
 
498 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  42.14 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  41.18 
 
 
514 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  41.02 
 
 
503 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.91 
 
 
503 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  41.34 
 
 
495 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.07 
 
 
532 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  41.45 
 
 
498 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  38.66 
 
 
529 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  40.66 
 
 
542 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  41.75 
 
 
546 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  39.54 
 
 
604 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  39.54 
 
 
604 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  39.35 
 
 
597 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  39.5 
 
 
594 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  39.54 
 
 
558 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  39.05 
 
 
608 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  39.05 
 
 
562 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  39.05 
 
 
562 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  39.05 
 
 
562 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  40.78 
 
 
525 aa  359  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  38.37 
 
 
568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  40.5 
 
 
545 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  40.33 
 
 
533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  39.83 
 
 
528 aa  353  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
530 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 
540 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  39.41 
 
 
534 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0960  glucan biosynthesis protein D  38.01 
 
 
514 aa  349  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1075  glucan biosynthesis protein D  38.01 
 
 
514 aa  349  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
545 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.42 
 
 
545 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 
544 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 
539 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.42 
 
 
545 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.19 
 
 
534 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.21 
 
 
498 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  38.1 
 
 
545 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.01 
 
 
542 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.01 
 
 
542 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
542 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
542 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  39.33 
 
 
539 aa  343  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  38.09 
 
 
530 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 
559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  39.47 
 
 
560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
527 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  41.25 
 
 
507 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  40.12 
 
 
560 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  38.48 
 
 
534 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  38.6 
 
 
529 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  39.42 
 
 
527 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  38.27 
 
 
540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>