More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2462 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 265 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  94.34 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  71.09 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  71.09 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  71.09 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  71.98 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  58.49 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  59.06 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  58.59 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  56.81 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  59.14 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  42.75 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  44.8 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  47.29 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  47.76 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  41.92 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  44 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  40.91 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.18 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.58 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.43 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  46.15 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  38.76 
 
 		 455 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.08 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  47.13 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.08 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  38.08 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 284 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  41.3 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.72 
 
 		 418 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  40.73 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  39.02 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  41.42 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  41.7 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.07 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  40.42 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  37.4 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.4 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  39.29 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.02 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.96 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  38.25 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.49 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.34 
 
 		 414 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  43.65 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.45 
 
 		 409 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  39.61 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  36.43 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  41.27 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  39.61 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>