More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2448 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  99.6 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  91.94 
 
 		 248 aa  467  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  88.31 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  88.71 
 
 		 248 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  88.31 
 
 		 248 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  87.5 
 
 		 248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  85.08 
 
 		 248 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  85.08 
 
 		 248 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1696  cysteine desulfurase ATPase component  84.68 
 
 		 248 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0464  FeS assembly ATPase SufC  68.85 
 
 		 246 aa  361  7.0000000000000005e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  71.31 
 
 		 261 aa  359  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 		 254 aa  351  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  67.62 
 
 		 252 aa  350  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 		 251 aa  344  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  65.45 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  65.57 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  64.52 
 
 		 258 aa  334  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  64.63 
 
 		 250 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  64.23 
 
 		 250 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  63.52 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  63.52 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  64.34 
 
 		 249 aa  327  8e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  62.6 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  63.31 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  63.01 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  61.79 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 280 aa  314  9e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  62.7 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  64.1 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  61.89 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  63.07 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  61.48 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  61.51 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 254 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  60.25 
 
 		 252 aa  307  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  59.51 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  59.5 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  60.25 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  58.26 
 
 		 252 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  58.94 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  57.09 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  58.94 
 
 		 260 aa  299  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  56.63 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  55.87 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  58.2 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  57.79 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  56.91 
 
 		 251 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  55.87 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  62.01 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  58.2 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  57.44 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  60.25 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.02 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  58.54 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  57.14 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  58.02 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 		 261 aa  292  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  57.02 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  54.66 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  56.79 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  57.02 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  56.97 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  56.97 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 		 252 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  57.79 
 
 		 268 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  58.2 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  57.79 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  57.79 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  57.38 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>