102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2440 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  97.56 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  79.15 
 
 		 284 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  77.66 
 
 		 283 aa  464  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  64.39 
 
 		 277 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  52.54 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  52.54 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  52.54 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  52.54 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  52.54 
 
 		 278 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  52.54 
 
 		 278 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  50.92 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  49.64 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  49.64 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  49.27 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  50.36 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  46.52 
 
 		 278 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  45.62 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  44.44 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  41.39 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  39.93 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  39.71 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  39.07 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  36.79 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  39.19 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  37.96 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  37.23 
 
 		 279 aa  195  9e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  37.45 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  59.35 
 
 		 164 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  34.98 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  35.87 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  35.19 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  35.04 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  34.53 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  34.18 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  34.69 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  32.23 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  31.91 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  33.46 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  30.04 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  30.4 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  29.67 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  30.04 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  32.62 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  29.67 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  29.67 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  29.67 
 
 		 282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  30.04 
 
 		 282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  29.3 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  29.3 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  29.3 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.07 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  28.68 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  29.2 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  29.54 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  32.26 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  29.2 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  31.97 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  28.88 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  30.26 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  29.07 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  28.97 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  27.53 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  29.46 
 
 		 892 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  26.67 
 
 		 652 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  25.96 
 
 		 891 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  25.96 
 
 		 550 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.18 
 
 		 897 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  25.96 
 
 		 892 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  39.71 
 
 		 692 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  25.96 
 
 		 891 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  25 
 
 		 891 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  25 
 
 		 891 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.78 
 
 		 696 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  26.67 
 
 		 901 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  36.23 
 
 		 661 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  35.82 
 
 		 646 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  36.36 
 
 		 674 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.13 
 
 		 977 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  29.47 
 
 		 646 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  35.94 
 
 		 646 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  35.94 
 
 		 646 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  35.94 
 
 		 643 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  32.81 
 
 		 648 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  35.94 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  22.54 
 
 		 741 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  21.94 
 
 		 655 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  30.77 
 
 		 624 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  30.77 
 
 		 624 aa  42.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>