233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2400 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  88.97 
 
 		 137 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  33.08 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  32.58 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  31.82 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  25.38 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  42.62 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.63 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  31.18 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  32.58 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.89 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  29.89 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  29.89 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  29.89 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  29.89 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  28.83 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>