149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2381 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  100 
 
 
155 aa  300  4e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  99.35 
 
 
155 aa  298  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  86.45 
 
 
155 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  78.06 
 
 
155 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  78.06 
 
 
155 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  78.06 
 
 
155 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  78.06 
 
 
155 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  78.06 
 
 
155 aa  223  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  86.45 
 
 
155 aa  222  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.432e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  76.13 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  74.84 
 
 
155 aa  211  4e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  70.97 
 
 
155 aa  200  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  70.32 
 
 
155 aa  198  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  70.32 
 
 
155 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  8.17006e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  73.38 
 
 
163 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  67.52 
 
 
155 aa  150  6e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  67.52 
 
 
155 aa  150  6e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  66.88 
 
 
155 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  56.13 
 
 
155 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0736  17 kDa surface antigen  60.65 
 
 
155 aa  132  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0665  outer membrane lipoprotein PcP  60 
 
 
155 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  45.71 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  44.29 
 
 
154 aa  80.5  8e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
150 aa  79.7  1e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  2.15158e-05  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  44.29 
 
 
154 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  44.29 
 
 
154 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  45.16 
 
 
154 aa  78.6  3e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  45.16 
 
 
154 aa  78.6  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  42.86 
 
 
154 aa  77.4  6e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  39.73 
 
 
154 aa  74.3  6e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  44.97 
 
 
154 aa  73.9  7e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  40.88 
 
 
157 aa  72.8  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  40.13 
 
 
159 aa  73.2  1e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34.64 
 
 
157 aa  72  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  34.59 
 
 
155 aa  71.2  5e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.76746e-05  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  42.34 
 
 
157 aa  70.5  9e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  42.34 
 
 
157 aa  70.5  9e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  42.34 
 
 
157 aa  70.5  9e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  5.9328e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  42.34 
 
 
157 aa  69.7  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  42.34 
 
 
157 aa  69.7  1e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  32.19 
 
 
153 aa  70.1  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  36.11 
 
 
155 aa  68.9  3e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  41.59 
 
 
157 aa  68.2  4e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  35.62 
 
 
158 aa  68.2  4e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  1.08744e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  40.68 
 
 
156 aa  66.6  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.41658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
164 aa  66.6  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.36943e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1150  Outer membrane lipoprotein-like  41.96 
 
 
303 aa  63.9  8e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  40.68 
 
 
156 aa  63.9  8e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0952  outer membrane lipoprotein pcp precursor  45.07 
 
 
153 aa  63.2  1e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.013543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
156 aa  62.8  2e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.72178e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  37.29 
 
 
160 aa  62.4  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.3242e-06  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
156 aa  62.4  3e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.63697e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
147 aa  62  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.3012e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  42.21 
 
 
154 aa  62  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  38.3 
 
 
162 aa  61.2  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
158 aa  61.6  4e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  37.41 
 
 
158 aa  61.2  5e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  36.11 
 
 
155 aa  60.8  6e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  36.73 
 
 
158 aa  59.7  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.08 
 
 
153 aa  58.5  3e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  47.97 
 
 
153 aa  58.9  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  58.2  5e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2606  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  36.77 
 
 
156 aa  57.8  6e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 
155 aa  57.4  6e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2888  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  36.77 
 
 
156 aa  57.8  6e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  40.68 
 
 
156 aa  57  9e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.19533e-08  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  38.14 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.26442e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  36.23 
 
 
155 aa  56.6  1e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  38.14 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.85697e-08  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  36.44 
 
 
156 aa  55.8  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.54513e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  33.59 
 
 
163 aa  55.1  3e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.17711e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0037  17 kDa surface antigen  48.28 
 
 
156 aa  55.1  4e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  38.98 
 
 
164 aa  54.7  5e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.54882e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  38.6 
 
 
272 aa  54.7  5e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  42.34 
 
 
157 aa  53.9  9e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2785  17 kDa surface antigen  42.22 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245544  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  39.45 
 
 
204 aa  52.8  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  39.45 
 
 
165 aa  50.4  9e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0915  17 kDa surface antigen  34.27 
 
 
156 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.852143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  39.39 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>