More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2375 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2375  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2659  Glutathione transferase  95.54 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  60 
 
 		 204 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  59.2 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  55.22 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  55.22 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  55.22 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  55.22 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  54.5 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  52.24 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1621  glutathionine S-transferase  54.5 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  0.633635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1723  glutathionine S-transferase  54 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1548  glutathionine S-transferase  54 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1891  glutathionine S-transferase  54 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1561  glutathionine S-transferase  54 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.174544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01605  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2005  Glutathione S-transferase domain protein  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0271018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1994  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  0.0251972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2347  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01595  hypothetical protein  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1711  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0312027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1845  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000002496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1825  glutathionine S-transferase  52.74 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.603364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.5 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  45 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  45 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0734  glutathione S-transferase-like  47.5 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.148589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  46.27 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.27 
 
 		 202 aa  191  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  47 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  45.5 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  46 
 
 		 204 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  45 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.5 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0817  glutathione S-transferase protein  46 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  46 
 
 		 202 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  45 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  45.69 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  42.5 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  43.5 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.06 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  45.27 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  44 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  42 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  44.28 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  46.27 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  42 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  42.29 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  43.81 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2442  glutathione S-transferase-like protein  45.45 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666537  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  43 
 
 		 209 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  43 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3328  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.934349 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.5 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  44.12 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  40.3 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3101  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.74 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  39.23 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  38.12 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4118  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4769  glutathione S-transferase-like  36.06 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3398  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.58 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0958  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0838  Glutathione S-transferase domain  37.13 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4046  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.31 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.862482  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  36.14 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2771  glutathione S-transferase-like protein  33.01 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  36.14 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.29 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  35 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  35.64 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  33.83 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  33.98 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.07 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.06 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02544  glutathione S-transferase GST-4.5  31.88 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0597  glutathione S-transferase, putative  35.66 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2872  putative glutathione S-transferase  35.66 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1730  putative glutathione S-transferase  35.66 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0484  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2840  glutathione S-transferase  35.66 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  30.92 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2419  putative glutathione S-transferase  35.66 
 
 		 147 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2779  putative glutathione S-transferase  35.66 
 
 		 147 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 		 299 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  33.01 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2721  putative glutathione S-transferase  34.97 
 
 		 147 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0556  glutathione S-transferase  33.99 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0613  putative glutathione S-transferase  32.7 
 
 		 233 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1303  glutathione S-transferase  34.95 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.6 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  31.88 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>