58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2370 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  94.96 
 
 		 258 aa  497  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  69.02 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  62.65 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  62.15 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  63.35 
 
 		 254 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  62.95 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  62.95 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  62.95 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  61.75 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  62.03 
 
 		 257 aa  304  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  55.7 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  36.6 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.24 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.19 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.2 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.09 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.66 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.09 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.31 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.23 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  27.16 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  27.16 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  27.16 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  31.39 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  32.24 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  27.23 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.41 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  30.24 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  31.1 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  35.62 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  30.63 
 
 		 437 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  38.03 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1046  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.73 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0678  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  28.83 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.86 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.03 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  36.51 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  39.34 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.86 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.8 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0284  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.71 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206751  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.78 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  23.89 
 
 		 212 aa  42  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>