150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2330 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.48 
 
 		 2421 aa  989    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  39.52 
 
 		 3322 aa  948    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40.86 
 
 		 3796 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 		 2600 aa  5224    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  38.38 
 
 		 1998 aa  770    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  44.06 
 
 		 2345 aa  1285    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.62 
 
 		 3967 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  33.93 
 
 		 3350 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  40.45 
 
 		 2588 aa  1315    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.96 
 
 		 3040 aa  699    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  40.35 
 
 		 2530 aa  1302    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.41 
 
 		 2545 aa  1315    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40.48 
 
 		 3862 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  42.67 
 
 		 3300 aa  615  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.46 
 
 		 3602 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  45.08 
 
 		 1268 aa  600  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.02 
 
 		 3790 aa  583  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  47.01 
 
 		 1077 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.86 
 
 		 3128 aa  556  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.98 
 
 		 658 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  34.48 
 
 		 3165 aa  510  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  34 
 
 		 3081 aa  503  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.44 
 
 		 3884 aa  483  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.98 
 
 		 3785 aa  474  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.74 
 
 		 3475 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  27.88 
 
 		 3141 aa  444  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.64 
 
 		 3159 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.69 
 
 		 3079 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.96 
 
 		 3147 aa  417  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.44 
 
 		 3301 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.09 
 
 		 3028 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.34 
 
 		 3144 aa  397  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.71 
 
 		 2984 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  46.21 
 
 		 683 aa  383  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.33 
 
 		 3480 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.76 
 
 		 2782 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.83 
 
 		 3378 aa  362  4e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  50 
 
 		 4966 aa  358  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  36.12 
 
 		 3004 aa  353  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  38.31 
 
 		 3526 aa  354  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.9 
 
 		 3020 aa  350  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.22 
 
 		 3501 aa  346  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  37.05 
 
 		 3141 aa  342  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  36.79 
 
 		 3141 aa  340  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.64 
 
 		 3552 aa  340  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  32.34 
 
 		 3131 aa  322  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0521  hypothetical protein  48.41 
 
 		 412 aa  308  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.718593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  38.66 
 
 		 1571 aa  302  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02991  filamentous haemagglutinin, N-terminal:Adhesin HecA 20-residue repeat x2  38.03 
 
 		 710 aa  296  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  32.04 
 
 		 3443 aa  290  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  32.44 
 
 		 5212 aa  290  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  32.96 
 
 		 3563 aa  282  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1521  hypothetical protein  59.15 
 
 		 397 aa  282  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  32.71 
 
 		 2758 aa  281  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  41.37 
 
 		 640 aa  278  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  43.22 
 
 		 660 aa  275  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  46.48 
 
 		 599 aa  273  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  24.28 
 
 		 2547 aa  265  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  31.83 
 
 		 6274 aa  261  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.58 
 
 		 5981 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  23.49 
 
 		 2542 aa  255  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02977  filamentous haemagglutinin  37.74 
 
 		 857 aa  254  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  38.74 
 
 		 594 aa  253  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.64 
 
 		 2670 aa  248  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.47 
 
 		 1730 aa  244  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  30.63 
 
 		 2061 aa  226  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.27 
 
 		 428 aa  224  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  25.33 
 
 		 2732 aa  219  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  24.87 
 
 		 2651 aa  214  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  37.58 
 
 		 2449 aa  212  8e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.13 
 
 		 812 aa  211  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.37 
 
 		 1723 aa  206  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  32.84 
 
 		 991 aa  200  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  29.72 
 
 		 2904 aa  197  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  33.83 
 
 		 1270 aa  187  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  35.44 
 
 		 1719 aa  181  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2848  putative hemagglutinin/hemolysin- related exoprotein  35.49 
 
 		 1038 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  35.14 
 
 		 2350 aa  177  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.04 
 
 		 721 aa  175  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  26.18 
 
 		 2964 aa  174  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3270  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1052 aa  174  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  33.14 
 
 		 541 aa  173  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1326  hypothetical protein  30.93 
 
 		 915 aa  173  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.987908  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  28.23 
 
 		 2737 aa  171  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.67 
 
 		 923 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  31.53 
 
 		 905 aa  165  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  31.53 
 
 		 905 aa  165  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  31.81 
 
 		 914 aa  164  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  31.31 
 
 		 911 aa  163  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  38.04 
 
 		 463 aa  163  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  37.5 
 
 		 1489 aa  159  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  31.63 
 
 		 901 aa  152  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.73 
 
 		 463 aa  152  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  31.12 
 
 		 898 aa  152  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  36.73 
 
 		 463 aa  152  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.61 
 
 		 2536 aa  152  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  34.52 
 
 		 1635 aa  151  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  31.82 
 
 		 893 aa  149  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  35.44 
 
 		 1618 aa  148  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.07 
 
 		 2827 aa  147  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>