More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2303 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0111  colicin-M  46.53 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.78894  hitchhiker  0.00593759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  63.04 
 
 		 112 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  61.7 
 
 		 94 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  64.29 
 
 		 123 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  61.46 
 
 		 103 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 		 100 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  59.18 
 
 		 99 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  58.16 
 
 		 99 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0572  bacteriocin, putative  33.33 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 		 99 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 		 99 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 		 99 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 		 99 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 		 99 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  56.12 
 
 		 99 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  56.12 
 
 		 99 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  55.1 
 
 		 99 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 		 99 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 		 99 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  54.08 
 
 		 99 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 		 104 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  55.1 
 
 		 99 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 		 98 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  53.12 
 
 		 97 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  55.21 
 
 		 98 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  52.27 
 
 		 94 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  53.54 
 
 		 99 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  54.76 
 
 		 88 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  54.17 
 
 		 96 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  49.02 
 
 		 104 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  48.98 
 
 		 99 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  52.17 
 
 		 98 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  47.47 
 
 		 99 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  51.55 
 
 		 102 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  47.52 
 
 		 104 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  47.52 
 
 		 104 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  50 
 
 		 99 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  52.22 
 
 		 99 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  44.34 
 
 		 106 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 		 113 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  40.48 
 
 		 89 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  45.78 
 
 		 111 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 		 99 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  33.93 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  39.53 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.75 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  42.5 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 		 99 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  40 
 
 		 101 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  48.68 
 
 		 111 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  43.33 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  44.44 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  38.04 
 
 		 121 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  41.98 
 
 		 93 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  48.57 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  46.27 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  39.51 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.26 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  49.25 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  40.66 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  41.76 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  33.33 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  43.66 
 
 		 350 aa  62  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  43.37 
 
 		 106 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  56.36 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  43.28 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  40 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  34.09 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.1 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.1 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  42.47 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  38.89 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.67 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  32.95 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  38.82 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.94 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  43.42 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  46.03 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  41.79 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  36.14 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  43.75 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.78 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.52 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  38.27 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.14 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  38.67 
 
 		 379 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2779  ferredoxin  36.36 
 
 		 115 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.643117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  36.25 
 
 		 106 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>