196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2178 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  61.88 
 
 
549 aa  694    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
554 aa  1137    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  89.53 
 
 
554 aa  1027    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  64.91 
 
 
558 aa  730    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  55.78 
 
 
557 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  50.37 
 
 
568 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  43.04 
 
 
560 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  32.35 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  32.35 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  33.95 
 
 
569 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  31.83 
 
 
565 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.6 
 
 
562 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  33.4 
 
 
570 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.38 
 
 
585 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.53 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.87 
 
 
562 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  30.87 
 
 
562 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.29 
 
 
565 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.21 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.55 
 
 
591 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.71 
 
 
591 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.38 
 
 
591 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  29.29 
 
 
562 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  29.29 
 
 
562 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.29 
 
 
562 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  29.36 
 
 
562 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  27.47 
 
 
583 aa  203  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.96 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.62 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  31.4 
 
 
586 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.87 
 
 
592 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  31.07 
 
 
586 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30 
 
 
586 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  29.12 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  30 
 
 
561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.13 
 
 
575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  31.02 
 
 
568 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  30.79 
 
 
585 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  31.9 
 
 
585 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.21 
 
 
580 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.94 
 
 
593 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  27.81 
 
 
583 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  30.88 
 
 
558 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.7 
 
 
594 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  29.6 
 
 
584 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  30.55 
 
 
590 aa  190  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.14 
 
 
595 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  27.62 
 
 
578 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.53 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.42 
 
 
584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 
597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.12 
 
 
608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.45 
 
 
580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  29.98 
 
 
590 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.51 
 
 
585 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.89 
 
 
563 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  30.48 
 
 
588 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.45 
 
 
563 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  27.49 
 
 
570 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  31.75 
 
 
575 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.16 
 
 
582 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.7 
 
 
610 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  28.04 
 
 
602 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  27.08 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  26.89 
 
 
581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  26.84 
 
 
572 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  27.16 
 
 
550 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.97 
 
 
581 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  28.47 
 
 
570 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  28.66 
 
 
590 aa  163  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.71 
 
 
581 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  28.45 
 
 
590 aa  161  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.69 
 
 
568 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  26.62 
 
 
564 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  24.75 
 
 
566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  28.85 
 
 
547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  23.71 
 
 
554 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  24.26 
 
 
574 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  23.98 
 
 
554 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  23.98 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.22 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  23.98 
 
 
558 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  23.98 
 
 
558 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  24.07 
 
 
520 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.78 
 
 
553 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.25 
 
 
570 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  23.67 
 
 
554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.78 
 
 
553 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.52 
 
 
559 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  28.16 
 
 
565 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.49 
 
 
593 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.25 
 
 
560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.1 
 
 
566 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.93 
 
 
587 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.86 
 
 
556 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.75 
 
 
607 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.69 
 
 
561 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.88 
 
 
583 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.16 
 
 
585 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.73 
 
 
561 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>