118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2177 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  68.92 
 
 
5981 aa  2293    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.68 
 
 
3796 aa  801    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.88 
 
 
3967 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  100 
 
 
1730 aa  3318    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.94 
 
 
3790 aa  774    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.8 
 
 
3862 aa  890    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.17 
 
 
3040 aa  525  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  31.56 
 
 
6274 aa  357  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  31.75 
 
 
2758 aa  353  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  30.64 
 
 
3443 aa  351  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  30.31 
 
 
5212 aa  341  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  33.27 
 
 
3300 aa  332  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  30.77 
 
 
3563 aa  326  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.72 
 
 
3602 aa  288  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.13 
 
 
1723 aa  280  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  47.44 
 
 
594 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.83 
 
 
2670 aa  270  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  30.71 
 
 
3322 aa  257  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  29.88 
 
 
3159 aa  244  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  31.03 
 
 
3350 aa  244  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  31.07 
 
 
3301 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.72 
 
 
2530 aa  240  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.58 
 
 
2588 aa  239  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.58 
 
 
2545 aa  237  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.63 
 
 
2600 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.3 
 
 
2345 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  43.07 
 
 
2827 aa  236  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.48 
 
 
3141 aa  235  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  30.24 
 
 
3165 aa  233  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  30.09 
 
 
3131 aa  232  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.91 
 
 
3475 aa  232  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  28.99 
 
 
3147 aa  228  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.82 
 
 
3028 aa  226  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  27.64 
 
 
3144 aa  226  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.71 
 
 
658 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.4 
 
 
3128 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.16 
 
 
2421 aa  221  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  30.62 
 
 
3501 aa  221  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  30.23 
 
 
3552 aa  220  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  33.08 
 
 
3004 aa  214  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  33.07 
 
 
3141 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  33.07 
 
 
3141 aa  213  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.33 
 
 
3378 aa  204  8e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.33 
 
 
3480 aa  204  9e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  28.41 
 
 
3081 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.77 
 
 
3884 aa  203  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.52 
 
 
3020 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.31 
 
 
3079 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.84 
 
 
2782 aa  199  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.01 
 
 
3785 aa  199  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  40.71 
 
 
1998 aa  194  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  46.62 
 
 
3526 aa  194  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  44.37 
 
 
4966 aa  194  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  32.98 
 
 
2984 aa  190  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.88 
 
 
812 aa  191  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.44 
 
 
428 aa  173  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.62 
 
 
2536 aa  169  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  34.45 
 
 
2449 aa  167  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  37.17 
 
 
1489 aa  163  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  38.25 
 
 
1651 aa  163  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.85 
 
 
1508 aa  157  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  29.32 
 
 
1841 aa  157  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.23 
 
 
1508 aa  157  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  38.81 
 
 
1270 aa  156  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.73 
 
 
721 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.84 
 
 
923 aa  153  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  28.09 
 
 
2737 aa  152  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  30.1 
 
 
3929 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  33.23 
 
 
2350 aa  150  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.08 
 
 
1508 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  25.36 
 
 
2651 aa  148  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.06 
 
 
1508 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.14 
 
 
2666 aa  147  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  33.96 
 
 
1719 aa  145  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  27.53 
 
 
1745 aa  142  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.87 
 
 
2818 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  40.24 
 
 
1618 aa  140  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  55 
 
 
1615 aa  137  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  39.02 
 
 
1635 aa  137  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.8 
 
 
2847 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  25.03 
 
 
2732 aa  133  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  25.39 
 
 
2964 aa  133  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  25.15 
 
 
2542 aa  131  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  28.98 
 
 
914 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  27.15 
 
 
2691 aa  128  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  24.97 
 
 
2547 aa  127  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  37.23 
 
 
463 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  29 
 
 
905 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  28.7 
 
 
893 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  32.39 
 
 
716 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  29 
 
 
905 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  28.42 
 
 
901 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  29 
 
 
911 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  29 
 
 
898 aa  123  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.93 
 
 
463 aa  119  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  35.93 
 
 
463 aa  118  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  33.57 
 
 
1631 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  36.61 
 
 
1615 aa  116  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.95 
 
 
678 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.64 
 
 
2786 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>