More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2154 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  96.72 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  78.55 
 
 		 275 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  78.99 
 
 		 272 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  77.37 
 
 		 272 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  76.77 
 
 		 257 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.04 
 
 		 261 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  69.72 
 
 		 261 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  69.66 
 
 		 636 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  69.66 
 
 		 636 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  69.66 
 
 		 636 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.66 
 
 		 636 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.23 
 
 		 636 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  70.23 
 
 		 636 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  70.23 
 
 		 636 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.18 
 
 		 594 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  67.05 
 
 		 619 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  69.84 
 
 		 602 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.72 
 
 		 594 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 		 592 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.6 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  68.27 
 
 		 598 aa  341  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.15 
 
 		 597 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 		 260 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.13 
 
 		 595 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  64.77 
 
 		 597 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.77 
 
 		 597 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.27 
 
 		 595 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  61.69 
 
 		 268 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  62.98 
 
 		 264 aa  328  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  59.18 
 
 		 274 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  64.26 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  62.95 
 
 		 256 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  62.25 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  59.38 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  58 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  56.57 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 		 299 aa  304  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.32 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 273 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.85 
 
 		 581 aa  302  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  57.14 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  58.63 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.87 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.4 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58 
 
 		 250 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.78 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  57.2 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.96 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.56 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.33 
 
 		 256 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  57.55 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56.8 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.82 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  55.17 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.94 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.78 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.43 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.13 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.92 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  56.32 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.42 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.51 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.63 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.58 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  55.42 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 270 aa  271  9e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.91 
 
 		 255 aa  271  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54 
 
 		 246 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.75 
 
 		 567 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  55.2 
 
 		 246 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  55.2 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  57.77 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.4 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 		 240 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  52.34 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.35 
 
 		 567 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  53.49 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 244 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.62 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  54 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.2 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  52.8 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.57 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.4 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  55.42 
 
 		 249 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  53.2 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>