51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1795 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  90.96 
 
 		 188 aa  349  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  66.3 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  63.83 
 
 		 192 aa  240  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  63.3 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  63.3 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  63.39 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  63.39 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  56.38 
 
 		 188 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  54.26 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  54.26 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  54.26 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  54.26 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  54.26 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  54.7 
 
 		 182 aa  197  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  54.7 
 
 		 182 aa  197  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  51.37 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  52.13 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  32.98 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  32.98 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  35.75 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  32.95 
 
 		 221 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  35.26 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  32.62 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  27.93 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  32.09 
 
 		 197 aa  84.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  35.17 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  24.04 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  22.99 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  26.46 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  27.94 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  22.99 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  29.17 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  26.4 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  28.85 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.26 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  29.93 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  24.87 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.18 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>