45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1789 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  92.82 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  68.86 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  69.49 
 
 		 184 aa  245  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  63.01 
 
 		 183 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  63.01 
 
 		 183 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  62.43 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  67.07 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  60.48 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000438094  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  60.48 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000404596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  60.48 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000152866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  60.48 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000043428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000720846  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000222204  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000481867  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000278688  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000020025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  59.88 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000798367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  59.88 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000982581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  59.88 
 
 		 180 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  41.76 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  40.59 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  38.32 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  36.11 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  34.32 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  33.73 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000237995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  32.54 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000237237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  32.54 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  31.95 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  31.95 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  31.36 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  31.36 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  31.36 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  31.36 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  26.44 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  29.05 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>