More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1782 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  95.81 
 
 
215 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  76.67 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  74.88 
 
 
215 aa  350  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  73.02 
 
 
215 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  73.02 
 
 
215 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  72.56 
 
 
215 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  72.09 
 
 
215 aa  343  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  72.09 
 
 
215 aa  343  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  72.09 
 
 
215 aa  343  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  74.29 
 
 
211 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  72.09 
 
 
215 aa  342  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  71.63 
 
 
215 aa  342  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  71.63 
 
 
215 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  71.63 
 
 
215 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  71.63 
 
 
215 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  71.63 
 
 
215 aa  340  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  72.56 
 
 
215 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.16 
 
 
215 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.16 
 
 
215 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.16 
 
 
215 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.16 
 
 
215 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.16 
 
 
215 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  61.06 
 
 
213 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  60.1 
 
 
213 aa  277  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  61.14 
 
 
212 aa  276  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  59.52 
 
 
214 aa  277  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  58.1 
 
 
214 aa  274  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  60.48 
 
 
214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  58.57 
 
 
215 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  56.67 
 
 
214 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  58.1 
 
 
214 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  56.67 
 
 
214 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  57.62 
 
 
214 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  57.62 
 
 
214 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  58.1 
 
 
241 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  56.67 
 
 
214 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 
214 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  58.1 
 
 
214 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  56.48 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  59.05 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  58.22 
 
 
214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  57.08 
 
 
214 aa  267  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  56.67 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 
214 aa  266  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  58.22 
 
 
214 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.29 
 
 
215 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  57.62 
 
 
237 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  57.62 
 
 
214 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  57.62 
 
 
214 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.63 
 
 
216 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  60.1 
 
 
213 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  54.63 
 
 
218 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  52.56 
 
 
217 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  55.24 
 
 
212 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  54.17 
 
 
218 aa  262  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  55.71 
 
 
214 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  58.17 
 
 
214 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  55.71 
 
 
223 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  55.98 
 
 
212 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  57.08 
 
 
214 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  55.45 
 
 
216 aa  258  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  58.17 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  58.17 
 
 
226 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.77 
 
 
212 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  54.33 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  55.29 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  55.29 
 
 
214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  52.4 
 
 
237 aa  251  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  53.05 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  54.33 
 
 
240 aa  251  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  54.33 
 
 
214 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  54.33 
 
 
216 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  55.34 
 
 
230 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  52.15 
 
 
213 aa  249  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  56.59 
 
 
222 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  56.13 
 
 
221 aa  248  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  54.25 
 
 
483 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  57.35 
 
 
222 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0660  metallo-beta-lactamase family protein  60.48 
 
 
234 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.548963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 
212 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  54.41 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  55.24 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  53.59 
 
 
214 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  56.59 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 
214 aa  242  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  54.76 
 
 
218 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  54.81 
 
 
221 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  52.8 
 
 
215 aa  240  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  52.4 
 
 
214 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 
214 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>