More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1776 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  100 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  93.1 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  75.09 
 
 		 278 aa  424  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  72.41 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  76.63 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  72.03 
 
 		 261 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  72.41 
 
 		 261 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  69.35 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  67.05 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  67.72 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  67.72 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  67.72 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  67.72 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  67.32 
 
 		 267 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  66.27 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  47.66 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  47.15 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  46.48 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  47.27 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  46.03 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  45.02 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  45.02 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  43.65 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  43.82 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  43.82 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  42.35 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  44.36 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  43.48 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  41.54 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  42.63 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  42.58 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  39.84 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  41.37 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  41.04 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  40.64 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  40.64 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  43.03 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  42.63 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  42.23 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  38.28 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  39.7 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  40 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.36 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  36.58 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  37.33 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.27 
 
 		 199 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  28.82 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  27.7 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  28.86 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  29.17 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.14 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.78 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.99 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.66 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.7 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  23.28 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.2 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.8 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.85 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.13 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 402 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.89 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>