More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1766 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  97.62 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  72.22 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  72.22 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  71.83 
 
 		 252 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.15 
 
 		 252 aa  338  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  60.16 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  58.57 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 252 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  57.77 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  57.6 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  58.33 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  57.77 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  57.37 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  58.17 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  56.97 
 
 		 251 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  58.27 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 252 aa  294  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  53.39 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  56.8 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  55.6 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  56 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  54.58 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  54 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  48.61 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  48.41 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  48.41 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  50.8 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 251 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  49 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  46.61 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  49 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  46.75 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  45.42 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  45.02 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  45.02 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  45.42 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.6 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  42.32 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  41.15 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  40.85 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1392  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00709289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  40.66 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40.34 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  39.92 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40.34 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  38.33 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  39.59 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  38.8 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 273 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 264 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  39.48 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>