248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1737 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 618 aa  1284    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  42.8 
 
 		 928 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 626 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.28 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.28 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  32.87 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.97 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.73 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 625 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  27.87 
 
 		 537 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 587 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  26.54 
 
 		 592 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  25.79 
 
 		 552 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  28.01 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 554 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 563 aa  144  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  27.87 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  25.47 
 
 		 555 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  25.61 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  27.23 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  27.54 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  26.43 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 585 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  26.12 
 
 		 604 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 		 586 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 557 aa  133  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  26.34 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  23.19 
 
 		 581 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  25.09 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.07 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  25.74 
 
 		 601 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  26.03 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  25.61 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1989  amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.829249  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1877  amidohydrolase 3  26.46 
 
 		 736 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.393763  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 562 aa  117  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.37 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.72 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.52 
 
 		 597 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  25.23 
 
 		 650 aa  110  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  25.64 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.09 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.5 
 
 		 539 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  24.25 
 
 		 556 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  25.43 
 
 		 569 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.12 
 
 		 552 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  23.73 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.46 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  24.83 
 
 		 553 aa  98.2  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.26 
 
 		 560 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  22.61 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.53 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25 
 
 		 546 aa  94.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  24.57 
 
 		 537 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  24.81 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  23.62 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  23.37 
 
 		 543 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  24.04 
 
 		 535 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  24.19 
 
 		 589 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  24.14 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  23.81 
 
 		 620 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 525 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  24.41 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  23.28 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  24.26 
 
 		 548 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  23.61 
 
 		 603 aa  88.2  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.5 
 
 		 541 aa  87.8  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.74 
 
 		 540 aa  87.4  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.03 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  23.75 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  24 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  22.82 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  22.42 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  23.5 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.52 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  23.6 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  23.6 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  22.58 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  21.8 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  21.8 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  22.51 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.6 
 
 		 557 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  23.25 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  24.14 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 545 aa  83.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  23.9 
 
 		 576 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  22.87 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  22.87 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  25.18 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  23.62 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  24.14 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>