60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1726 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  756    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  81.84 
 
 		 369 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  47.11 
 
 		 366 aa  362  8e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  44.93 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  49.86 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  49.86 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  45.21 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  47.66 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  45.35 
 
 		 362 aa  308  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  43.4 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  44.14 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  44.04 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  45.08 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  42.74 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  39.62 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  42.02 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  41.18 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  38.59 
 
 		 372 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  38.66 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  40.3 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  33.97 
 
 		 374 aa  232  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  39.4 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  34.78 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  38.95 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  36.18 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  40.43 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  36.16 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  35.93 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  31.84 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  30.29 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  31.25 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  28.88 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  29.73 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  30.06 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  28.1 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  28.25 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  26.7 
 
 		 983 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  25.52 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  28.98 
 
 		 999 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  26.23 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  26.92 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  28.49 
 
 		 358 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 		 994 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  23.57 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.27 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  27.27 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  25.07 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  24.49 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  24.64 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  23.92 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  28.2 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  27.65 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  22.1 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  21.97 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  23.21 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  24.3 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  20.54 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  23.46 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>