More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1525 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  100 
 
 		 343 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2938  transport system permease protein  95.92 
 
 		 343 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  59.48 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  61.52 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  54.81 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  47.43 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  46 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  46.29 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  46.29 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  46.29 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  46.29 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  46.29 
 
 		 352 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  46.57 
 
 		 352 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  46.26 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1041  transport system permease protein  51.34 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  44.44 
 
 		 353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  48.8 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  41.84 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  42.34 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  42.34 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.92 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.92 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.92 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  44.51 
 
 		 351 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.92 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  42.03 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  40.5 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  36.86 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  36.86 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  38.69 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  43.93 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  41.85 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.34 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.66 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  38.34 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  38.34 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  38.34 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  34.36 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  35.8 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  40.77 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  35.5 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  35.5 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  37.35 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  37.35 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  35.8 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.06 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  37.99 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.73 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.92 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  35.96 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  43.34 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.31 
 
 		 678 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  38.2 
 
 		 319 aa  186  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  33.43 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  33.43 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  36.83 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  34.67 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1047  transport system permease protein  39.7 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.31 
 
 		 678 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  42.72 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.69 
 
 		 678 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35 
 
 		 678 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35 
 
 		 678 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  35.19 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35 
 
 		 678 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  34.02 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  34.9 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  34.9 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  34.9 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  39.58 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  39.34 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  34.91 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  34.91 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  35.1 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.75 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  36.77 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>