184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1447 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  47.57 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  46.04 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  45.45 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  44.9 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  44.39 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  43.94 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  32.66 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  35.42 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  32.04 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  32.8 
 
 		 292 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  30.96 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  32.98 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  32.98 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  34.17 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  31.77 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  34.78 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  31.19 
 
 		 251 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  29.69 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  29.69 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  31.11 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  31.88 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  30.34 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  28.87 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  31.55 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  30.54 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  29.81 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  34.31 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  31.03 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  30.46 
 
 		 460 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  31.98 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  26.57 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  29.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  29.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  29.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  29.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  28.22 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  32.75 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  31.05 
 
 		 449 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  29.59 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  32.98 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  25.98 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  27.12 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  28.86 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  24.76 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1580  paraquat-inducible protein A  25.85 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.230902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  26.97 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  30.1 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  21.61 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1773  paraquat-inducible protein A  28.35 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23148  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  25.25 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  28.1 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  28.96 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  23.59 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  27.55 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2128  paraquat-inducible protein A  26.44 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  normal  0.0903453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  25 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  27.7 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  24.4 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  29.28 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  25.85 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  26.29 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  24.04 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2233  paraquat-inducible protein A  24.02 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.80452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  24.4 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  23.2 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1930  paraquat-inducible protein A  23.94 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  26.98 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  26.61 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  27.59 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  23.19 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>