More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1436 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 669 aa  1378    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  70.28 
 
 		 673 aa  986    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  35.16 
 
 		 691 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 680 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.96 
 
 		 685 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 722 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.86 
 
 		 715 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 695 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 695 aa  153  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 687 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 724 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 734 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 694 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 713 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 688 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 666 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 641 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 751 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 762 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 693 aa  128  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 670 aa  127  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 697 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 720 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 732 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 752 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 690 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 649 aa  124  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 732 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 692 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 		 822 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 766 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 774 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 717 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 771 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 734 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 704 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 764 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 765 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 767 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 		 856 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 803 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 733 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 773 aa  114  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 777 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 749 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  24.32 
 
 		 747 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 725 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 800 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 800 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 751 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 744 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 853 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 746 aa  107  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 753 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 713 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 761 aa  105  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 731 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 729 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 729 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 743 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 851 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 761 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 728 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 769 aa  102  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 790 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 777 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 		 754 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 733 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 711 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 780 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 790 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 759 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 710 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 764 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 739 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 733 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 741 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 743 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 771 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 758 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 696 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 730 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>