24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1421 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  907    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  25.57 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  26.08 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  28.05 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  26.58 
 
 		 646 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  23.71 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  24.63 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  23.22 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  24.44 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.4 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  20.62 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  22.14 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  23.53 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  21.5 
 
 		 482 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  22.31 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  23.44 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  21.8 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  22.49 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  23.37 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  23.26 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  21.62 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  21.57 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  24.66 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  20.05 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>