More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1409 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  57.51 
 
 		 598 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  57.99 
 
 		 588 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  65.18 
 
 		 602 aa  723    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  65 
 
 		 602 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  65 
 
 		 602 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 619 aa  1248    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  57.97 
 
 		 575 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  58.19 
 
 		 575 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  56.75 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  52.9 
 
 		 578 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  52.63 
 
 		 578 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  52.55 
 
 		 578 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 599 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  60.39 
 
 		 575 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  57.75 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  56.81 
 
 		 593 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  63.59 
 
 		 595 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  63.77 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  54.34 
 
 		 585 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  55.83 
 
 		 573 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  50.83 
 
 		 580 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  49.08 
 
 		 584 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.5 
 
 		 591 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.4 
 
 		 596 aa  534  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  49.91 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  47.73 
 
 		 603 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.87 
 
 		 585 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  45.65 
 
 		 574 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  44.52 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  42.21 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  45.08 
 
 		 589 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.68 
 
 		 570 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  44.44 
 
 		 643 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  43.28 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.54 
 
 		 563 aa  465  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  42.76 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  44.72 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  43.33 
 
 		 591 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  44.32 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  43.41 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  44.44 
 
 		 589 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  43.08 
 
 		 582 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  45.85 
 
 		 581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  42.73 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  41.06 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.44 
 
 		 587 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  43.86 
 
 		 582 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  45.34 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  42 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  40.87 
 
 		 581 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  42.83 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  41.93 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  40.7 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.91 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.05 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  42.21 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  40.79 
 
 		 581 aa  425  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  42.45 
 
 		 600 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  41.05 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  40.61 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  42.63 
 
 		 598 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  41.99 
 
 		 668 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  42.13 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  41.81 
 
 		 591 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.27 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  42.13 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  42.36 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.96 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  41.99 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  41.26 
 
 		 589 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  42.83 
 
 		 582 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  42.56 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  40.04 
 
 		 577 aa  412  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  38.08 
 
 		 590 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.25 
 
 		 671 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  41.22 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  41.39 
 
 		 578 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.83 
 
 		 592 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  40.19 
 
 		 576 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  40.64 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.81 
 
 		 574 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  41.01 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.81 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  40.33 
 
 		 580 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.79 
 
 		 560 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  40.11 
 
 		 578 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  40.11 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  40.19 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  39.19 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.53 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  39.61 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.05 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  39.59 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.94 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  38.56 
 
 		 592 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  41.03 
 
 		 742 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  43.27 
 
 		 574 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  38.64 
 
 		 782 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  41.16 
 
 		 598 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>