More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1390 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  97.48 
 
 		 238 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  85.59 
 
 		 237 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  85.14 
 
 		 237 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  84.68 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2804  ABC transporter component  61.09 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  61.72 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  61.24 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  61.24 
 
 		 217 aa  278  6e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0428  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  57.42 
 
 		 224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00313991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  55.24 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0768  response regulatory protein  56.94 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319158  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  55.24 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 		 408 aa  258  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.81 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  53.46 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3548  ABC transporter related  50.23 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.21 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  52.68 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  50.72 
 
 		 657 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.32 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.95 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.31 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.98 
 
 		 642 aa  203  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.39 
 
 		 644 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.39 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.11 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  50.25 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.11 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.29 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  48.11 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.76 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  49.25 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.5 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.75 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  46.98 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  47.93 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.49 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.54 
 
 		 228 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.86 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  47.47 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  47.76 
 
 		 232 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  47.41 
 
 		 280 aa  197  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.25 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.67 
 
 		 642 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  43.53 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  45.33 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.25 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.57 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.88 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45.73 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.75 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.5 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.45 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  45 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.79 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  44.24 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  44.05 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  48.61 
 
 		 291 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  45.41 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  47.06 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  44.84 
 
 		 667 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  49.24 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  44.59 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  44.84 
 
 		 667 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  45.33 
 
 		 655 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.5 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>