73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1347 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  68.95 
 
 		 278 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  38.55 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  35.36 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  38.91 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  34.07 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  36.6 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  33.09 
 
 		 311 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  32.12 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  32.6 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  33.09 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  32.23 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  32.6 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  31.18 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  32.25 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  31.88 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  33.94 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  30.74 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  31.77 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  32.03 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  31.5 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  30.82 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  28.83 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  30.88 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  27.84 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  27.84 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  27.66 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  26.55 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  25 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  27.47 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  27.47 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  27.47 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  27.47 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  27.96 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  27.96 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  29.03 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  27.6 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  29.86 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  27.6 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  27.6 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  27.6 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  27.24 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  27.24 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  27.24 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  27.54 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  30.94 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  27.44 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  27.17 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  27.44 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  31.54 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  23.7 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  27.11 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  28.67 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  26.01 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  24.36 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  27.08 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  23.05 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  27.17 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.43 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  30.26 
 
 		 164 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.45 
 
 		 901 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  26.77 
 
 		 977 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  22.16 
 
 		 651 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  22.16 
 
 		 651 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.34 
 
 		 625 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  24.74 
 
 		 646 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  24.74 
 
 		 646 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  24.74 
 
 		 646 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>