More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1338 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  81.75 
 
 		 515 aa  886    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  81.75 
 
 		 515 aa  886    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  84.66 
 
 		 521 aa  885    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  97.09 
 
 		 515 aa  1024    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  81.36 
 
 		 515 aa  884    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  100 
 
 		 515 aa  1055    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  47.63 
 
 		 495 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.22 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.66 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.66 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.38 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.11 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.83 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.11 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.66 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.06 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.06 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.75 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.53 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  42.03 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43.94 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  41.81 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  42.77 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 501 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.43 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.11 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43.94 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.39 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.73 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.32 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.15 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  41.47 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.8 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.52 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.45 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.52 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.95 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.52 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.28 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.39 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.83 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.89 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.96 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.28 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.55 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.28 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.39 
 
 		 524 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.28 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  41.63 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.32 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.87 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.89 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  43.28 
 
 		 500 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.24 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.24 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.9 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.12 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.67 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.04 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  41.43 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.41 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  41.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.56 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.04 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  41.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.27 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  41.47 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.83 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.51 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.01 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  41.47 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.4 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  41.4 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  41.26 
 
 		 525 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  40.51 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>