More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1134 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  71.4 
 
 		 487 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  74.9 
 
 		 524 aa  741    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  76.8 
 
 		 487 aa  767    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  70.37 
 
 		 487 aa  688    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 487 aa  984    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  72.43 
 
 		 487 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  72.22 
 
 		 487 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  77.66 
 
 		 487 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  72.22 
 
 		 487 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  74.9 
 
 		 494 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  77.66 
 
 		 488 aa  778    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  72.43 
 
 		 487 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  72.43 
 
 		 487 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  71.6 
 
 		 487 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  71.6 
 
 		 487 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  95.28 
 
 		 487 aa  919    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  71.4 
 
 		 487 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  74.9 
 
 		 494 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  49.59 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  50.78 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  48.47 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  48.22 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  44.64 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  44.78 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  44.03 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  43.31 
 
 		 489 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  43.1 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  43.1 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  43.31 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  45.41 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  43.1 
 
 		 489 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  42.35 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  42.35 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  42.35 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  42.35 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  43.36 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  43.57 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  43.88 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  43.04 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  40.87 
 
 		 483 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  40.68 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  39.87 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.79 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.91 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  35.21 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  35.65 
 
 		 478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  35.65 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  35.65 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.04 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  34.36 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  32.92 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  33.61 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  37.02 
 
 		 411 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  43.97 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.82 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  30.87 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  30.89 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 		 605 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 573 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  27.93 
 
 		 566 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 		 483 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  40.47 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  31.44 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 		 481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  35.8 
 
 		 533 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.31 
 
 		 561 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 		 569 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 565 aa  163  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  28.78 
 
 		 562 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  35.39 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  35.59 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  28.22 
 
 		 590 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  28.84 
 
 		 533 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  28.42 
 
 		 569 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  29.31 
 
 		 588 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  29.31 
 
 		 588 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.8 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  29.28 
 
 		 588 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 		 593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>