24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1084 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1086  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.67 
 
 		 665 aa  821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1085  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.03 
 
 		 669 aa  777    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 675 aa  1381    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.8 
 
 		 736 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.5 
 
 		 728 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3227  hypothetical protein  84.48 
 
 		 78 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00187211  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0013  F5/8 type C domain protein  30.07 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.538854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  30.86 
 
 		 718 aa  67.8  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  32.46 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  30.61 
 
 		 954 aa  65.1  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  35.11 
 
 		 1427 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  35.11 
 
 		 1422 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0121  hypothetical protein  29.81 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  27.66 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  36.56 
 
 		 1426 aa  57.4  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0120  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  28.87 
 
 		 475 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.72 
 
 		 1322 aa  54.7  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  31.31 
 
 		 540 aa  54.7  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30 
 
 		 834 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1065  hypothetical protein  29.32 
 
 		 775 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0270442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  25.74 
 
 		 206 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.19 
 
 		 1781 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  25.74 
 
 		 506 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>