More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1059 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.97 
 
 		 593 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.14 
 
 		 593 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.81 
 
 		 607 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.81 
 
 		 607 aa  876    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  100 
 
 		 591 aa  1199    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.44 
 
 		 594 aa  907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  79.05 
 
 		 592 aa  946    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  77.68 
 
 		 597 aa  919    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.45 
 
 		 593 aa  891    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  75.98 
 
 		 607 aa  878    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.636426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.97 
 
 		 593 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  92.37 
 
 		 601 aa  1120    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.97 
 
 		 593 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  74.62 
 
 		 593 aa  894    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  72.97 
 
 		 593 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  73.25 
 
 		 593 aa  896    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  50 
 
 		 592 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  48.96 
 
 		 591 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 592 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  40 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  41.9 
 
 		 606 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  38.92 
 
 		 587 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  39.12 
 
 		 587 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.44 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  39.62 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.62 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.62 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.44 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  39.44 
 
 		 587 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.29 
 
 		 579 aa  379  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.18 
 
 		 581 aa  364  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.14 
 
 		 600 aa  346  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  39.68 
 
 		 677 aa  346  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.92 
 
 		 666 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.92 
 
 		 666 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.73 
 
 		 666 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 666 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.73 
 
 		 666 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.54 
 
 		 666 aa  339  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 666 aa  334  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 622 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  34.72 
 
 		 602 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  36.35 
 
 		 666 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.63 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  31.78 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  31.61 
 
 		 599 aa  316  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  32.18 
 
 		 680 aa  313  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.64 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.12 
 
 		 611 aa  309  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.65 
 
 		 604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  32.18 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  29.14 
 
 		 607 aa  307  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.61 
 
 		 594 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.5 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.44 
 
 		 677 aa  300  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  34.66 
 
 		 650 aa  300  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.16 
 
 		 598 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.59 
 
 		 721 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  31.12 
 
 		 594 aa  297  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.15 
 
 		 592 aa  296  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  34.69 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  33.08 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 685 aa  293  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.37 
 
 		 597 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  34.06 
 
 		 610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.49 
 
 		 597 aa  290  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  31.53 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  31.53 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  30.62 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.5 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.14 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  30.27 
 
 		 627 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.46 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  33.2 
 
 		 663 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  33.56 
 
 		 619 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.35 
 
 		 618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  32.8 
 
 		 665 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  30.91 
 
 		 603 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  30.35 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.81 
 
 		 617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  35.12 
 
 		 666 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.78 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  31.64 
 
 		 602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.23 
 
 		 607 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  29.48 
 
 		 626 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  34.44 
 
 		 605 aa  283  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.34 
 
 		 582 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 733 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.1 
 
 		 669 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  30.59 
 
 		 625 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>