More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0800 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
321 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  91.59 
 
 
321 aa  607  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  74.6 
 
 
324 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  71.74 
 
 
323 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.13 
 
 
324 aa  321  8e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  55.67 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.3 
 
 
344 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  41.94 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.14 
 
 
312 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  36.27 
 
 
325 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  36.29 
 
 
300 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  31.63 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  31.38 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  34.15 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.01 
 
 
336 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  33.56 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  32.76 
 
 
644 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  33.08 
 
 
471 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.23 
 
 
321 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  29.81 
 
 
333 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  32.08 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  29.81 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  31.11 
 
 
334 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  31.11 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  31.11 
 
 
322 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  34.17 
 
 
340 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  30.07 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.18 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  29.15 
 
 
288 aa  109  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  30.38 
 
 
303 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.62 
 
 
407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.02 
 
 
407 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.93 
 
 
376 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  25.25 
 
 
280 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.45 
 
 
272 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  26.42 
 
 
317 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  31.6 
 
 
403 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.9 
 
 
308 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.74 
 
 
409 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.38 
 
 
311 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.59 
 
 
407 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.94 
 
 
347 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  30.18 
 
 
308 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  30 
 
 
318 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.35 
 
 
645 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.46 
 
 
420 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  27.24 
 
 
411 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  29.41 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  26.3 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  29.02 
 
 
391 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.09 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  27.76 
 
 
283 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.4 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  29 
 
 
431 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.07 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.97 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.52 
 
 
1094 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  26.97 
 
 
355 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  26.15 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.13 
 
 
302 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.31 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  26.95 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.6 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  28.8 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.76 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  26.82 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  28.9 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  26.29 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  26.2 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  27.6 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5474  esterase/lipase  26.49 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.32 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.64 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.91 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.7 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  38.14 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  26.16 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  26.39 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  27.56 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  27.56 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  27.56 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.27 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  35.66 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.67 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01420  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538282  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.67 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.65 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.65 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  24.58 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.43 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  29.03 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  25.84 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  35.16 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  26.36 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  25.47 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.18 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  44.09 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>