92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0777 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  94.68 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  80.5 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  80.5 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  80.5 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  80.5 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  80.5 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  73.62 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  79.67 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  78.42 
 
 		 253 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  79.25 
 
 		 253 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  77.55 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  81.43 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  81.43 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  81.43 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  74.21 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  62.5 
 
 		 250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  53.54 
 
 		 264 aa  291  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  57.2 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  55.23 
 
 		 257 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  56.54 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  51.64 
 
 		 257 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  55.37 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  50.4 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  53.11 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  59.28 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  54.85 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  51.88 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  51.61 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  51 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  48.63 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  48.63 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  49.39 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  50.84 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  50.84 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  50.84 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  49 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  50.42 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  49.79 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  53.56 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  50.21 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  43.9 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  42.74 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  43.15 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  46.91 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  43.4 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  43.4 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  46.44 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  42.92 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  41.63 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  42.5 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  42.19 
 
 		 242 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  42.19 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  42.5 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  42.51 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  43.62 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  36.63 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  36.02 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  43.12 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  42.37 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  40.89 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  35.16 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  33.48 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  27.94 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  29.15 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  30.84 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  23.87 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  27.67 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  25.21 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  27.01 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  29.78 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  27.18 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  26.98 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  26.99 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  28.48 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  24.21 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  28.84 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  27.4 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  25.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  24.38 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  23.53 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.436714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  25.95 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  27.43 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>