224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0753 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 332 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  99.07 
 
 		 321 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  90.62 
 
 		 320 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  71.38 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  71.38 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  60.32 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  59.87 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  54.52 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  55.48 
 
 		 326 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  51.36 
 
 		 337 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  52.05 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  52.05 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  52.05 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  52.05 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  52.05 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  52.05 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  52.05 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  53.92 
 
 		 310 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 318 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  33.87 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.17 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  27.67 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.72 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.25 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  33 
 
 		 700 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  25.64 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  31.48 
 
 		 694 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  30.34 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  30.34 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  30.34 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.48 
 
 		 694 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.16 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.16 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.7 
 
 		 695 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.16 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  28.43 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  26.27 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  24.92 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.56 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  26.27 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.92 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  27.99 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  29.57 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  29.55 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  29.45 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  27.49 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  30.79 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  27.27 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  26.89 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>