108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0560 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  97.19 
 
 		 320 aa  624  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  80.45 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.17 
 
 		 314 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  79.1 
 
 		 328 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  79.1 
 
 		 312 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  79.1 
 
 		 328 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  76.92 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  76.92 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  76.92 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  76.92 
 
 		 321 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  75.65 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  75 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  76.74 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.24 
 
 		 306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  75 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  47.39 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  41.75 
 
 		 319 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  42.41 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  42.07 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  42.66 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  41.86 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  42.19 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  40.45 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  39.1 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  37.92 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  39.66 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  37.75 
 
 		 312 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  31.65 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  31.53 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  31.53 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  31.21 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  31.21 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  31.21 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  30.87 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  31.27 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  28.67 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  32.03 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  29.57 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  31.51 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  28.71 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  28.1 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  28.23 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  27.88 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  27.27 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  27.27 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  27.27 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  27.27 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.23 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  27.1 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.75 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.03 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.19 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.61 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.8 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  23.9 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.74 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  27.92 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.09 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.37 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  21.74 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.22 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.23 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25.17 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  27.48 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.17 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.88 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  25.58 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.68 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  26.64 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  28.03 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0499  hypothetical protein  27.46 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.67 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  33.66 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  24.44 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.34 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  22.59 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.4 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.61 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>