160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0552 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0552  arginine repressor  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0787  arginine repressor  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000129579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3485  arginine repressor  97.44 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3366  arginine repressor  96.79 
 
 		 156 aa  312  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000452789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3672  arginine repressor  92.31 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3720  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3551  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3623  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.445148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3658  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.256744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3552  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3617  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.677285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3970  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.17136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3762  arginine repressor  91.03 
 
 		 156 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0469  arginine repressor, ArgR  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4554  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3426  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.784713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3720  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.699703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0469  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.191978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3533  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.402706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3539  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0468  arginine repressor  89.74 
 
 		 156 aa  291  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000150922  normal  0.831176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03097  arginine repressor  89.1 
 
 		 156 aa  287  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03048  hypothetical protein  89.1 
 
 		 156 aa  287  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001677  arginine pathway regulatory protein ArgR repressor of arg regulon  75.16 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2849  arginine repressor  75.82 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00794  arginine repressor  75.82 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0358  arginine repressor  71.79 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0671  arginine repressor  76.71 
 
 		 154 aa  230  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  73.68 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  73.68 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  73.68 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  73.68 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0866  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0489183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  72.37 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0640  arginine repressor  72.37 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  73.03 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1001  arginine repressor  79.41 
 
 		 156 aa  226  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0348249  hitchhiker  0.0000998634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0825  arginine repressor  72.37 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000490161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1056  arginine repressor  72.19 
 
 		 155 aa  221  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00416877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0295  arginine repressor  68.42 
 
 		 150 aa  210  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4515  arginine repressor  63.46 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00735  arginine repressor  63.33 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0538  arginine repressor  61.33 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0697  arginine repressor  51.09 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0588  arginine repressor  46.62 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597  arginine repressor  46.62 
 
 		 195 aa  126  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.926684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4745  arginine repressor, ArgR  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4844  arginine repressor ArgR  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4808  arginine repressor ArgR  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.777034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4864  arginine repressor ArgR  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4714  arginine repressor, ArgR  36.09 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371163  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0448  ArgR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  37.14 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  36.03 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  36.03 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  34.17 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  34.88 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  34.85 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  33.1 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  35.66 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  33.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  33.83 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  34.35 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  33.54 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  29.17 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  33.81 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  33.57 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  32.85 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  35.25 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  37.61 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  35.25 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  31.69 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  32.5 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  33.08 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  31.47 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  35.2 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  32.5 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  34.04 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  32.35 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  30.61 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  32.56 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  33.77 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  36.22 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  36.22 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  30 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  36.22 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  32.43 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  31.65 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  33.8 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  32.77 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  32.21 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>