173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0519 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0737  Glutathione transferase  95.77 
 
 		 331 aa  664    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0519  Glutathione transferase  100 
 
 		 331 aa  690    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3520  Glutathione transferase  78.77 
 
 		 328 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4332  hypothetical protein  77.85 
 
 		 328 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.164187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3421  hypothetical protein  76.23 
 
 		 328 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3394  Glutathione transferase  75.62 
 
 		 326 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3400  hypothetical protein  75.93 
 
 		 328 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3424  hypothetical protein  75.93 
 
 		 328 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3494  glutathione S-transferase  75.62 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3528  glutathione S-transferase  75.62 
 
 		 328 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0794367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0479  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.78 
 
 		 328 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.342726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1116  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.17 
 
 		 328 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.660957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0543  putative glutathione S-transferase  74.3 
 
 		 328 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02971  predicted S-transferase  75.62 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3259  hypothetical protein  75.62 
 
 		 328 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02922  hypothetical protein  75.62 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3575  hypothetical protein  75.31 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0594  putative transferase  75.62 
 
 		 328 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4417  hypothetical protein  75.31 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.243215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0599  conserved hypothetical protein  75.31 
 
 		 328 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3290  hypothetical protein  75.31 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3556  putative glutathione S-transferase  73.15 
 
 		 328 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.997645  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1469  hypothetical protein  68 
 
 		 334 aa  471  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1723  putative glutathione S-transferase  61.54 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.959435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2281  putative glutathione S-transferase  61.4 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.334105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0169  putative glutathione S-transferase  60.79 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2583  putative glutathione S-transferase  62.23 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378441  hitchhiker  0.0000439857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1604  putative glutathione S-transferase  62.88 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4107  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.85 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2798  putative glutathione S-transferase protein  62.77 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830078  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0157  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.23 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1431  Glutathione S-transferase domain  64.31 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.858691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3062  Glutathione transferase  61.61 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.795635  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1579  IMP dehydrogenase/GMP reductase  60.12 
 
 		 320 aa  418  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.39795  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1656  glutathione S-transferase-like protein  63.08 
 
 		 328 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0858873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1060  glutathione S-transferase-like protein  60.31 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0432833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1561  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.96 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0368  putative glutathione S-transferase  60.06 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3010  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.61 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1761  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  60.68 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0457126  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1509  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.96 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1455  glutathione S-transferase  59.57 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3798  Glutathione transferase  58.46 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3749  putative glutathione S-transferase domain protein  58.15 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2220  putative glutathione S-transferase  61.09 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2185  putative glutathione S-transferase  59.38 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0853  putative glutathione S-transferase  58.9 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3241  hypothetical protein  61.61 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2451  glutathione S-transferase-like protein  58.46 
 
 		 328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2382  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.31 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200845  hitchhiker  0.00582384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3343  glutathione S-transferase domain protein  59.69 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0421  Glutathione S-transferase domain protein  58.77 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0800  glutathione S-transferase family protein  57.91 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.170497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01866  predicted glutathione S-transferase  57.72 
 
 		 320 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4602  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.61 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0270  glutathione S-transferase-like protein  58.77 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0833  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.3 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2206  glutathione S-transferase domain  59.94 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1732  putative glutathione S-transferase  62.23 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1201  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  57.72 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4679  glutathione S-transferase  60 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0018476  normal  0.811499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1591  glutathione S-transferase  59.38 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0102059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1137  glutathione S-transferase-like protein  58.15 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1276  glutathione S-transferase-like protein  57.28 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.248613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3173  glutathione S-transferase  60.92 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00834224  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2524  Glutathione S-transferase domain  59.33 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0524835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3580  fructose-bisphosphate aldolase  60.92 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0521  putative glutathione S-transferase  55.81 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0242  glutathione S-transferase  58.46 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0614  hypothetical protein  56.88 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2249  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.72 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.386562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1775  hypothetical protein  55.16 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0374  hypothetical protein  57.89 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.520714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02944  glutathione S-transferase  56.44 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30350  hypothetical protein  57.23 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2598  hypothetical protein  56.62 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1173  putative glutathione S-transferase  55.31 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1210  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.2 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002964  predicted glutathione S-transferase  54.91 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3495  putative glutathione S-transferase  55 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2671  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.92 
 
 		 337 aa  362  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0021828  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2507  hypothetical protein  53.25 
 
 		 319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2137  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.55 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000359074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2361  hypothetical protein  52.63 
 
 		 319 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3402  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.13 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0702  putative glutathione S-transferase  55.69 
 
 		 327 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2323  Glutathione transferase  52.47 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.131425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1835  glutathione S-transferase-like protein  55.18 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3603  hypothetical protein  55.21 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3998  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.21 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721034  hitchhiker  0.00627186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1686  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.13 
 
 		 317 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2008  glutathione S-transferase-like protein  51.07 
 
 		 319 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3239  putative glutathione S-transferase  51.84 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1170  Glutathione transferase  49.23 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.56227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4511  glutathione S-transferase-like  50.46 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0634  glutathione S-transferase  50.9 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.240948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0652  glutathione S-transferase  48 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2675  glutathione S-transferase  50.32 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2543  glutathione S-transferase  47.69 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0355299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5405  Glutathione transferase  52.44 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>